Berdasarkan cerit rakyat sebelum berdirinya desa Wates, terdapat tiga padukuhan yang kemudian digabung menjadi desa Wates. Adapun tiga padukuhan tersebut adalah dukuh Nglegok, yang diambil dari nama suatu kejadian yang berawal adanya hewan celeng yang lari dari gunung Podo dan akhirnya mogok seterusnya di Nglegok.

                Dukuh selanjutnya adalah dukuh Duwet yang diambil dari nama pohon duwet karena wilayah tersebut waktu dibabad banyak pohon duwet. Sedangkan dukuh sekanjutnya adalah dukuh Domasan, yang diambil dari nama banyak orang yang bekerja mendirikan usaha sepuhan atau kemasan sehingga disebut dukuh Domasan.

                Dari tiga dukuhan tersebut berbatasan dengan desa lain dengan membuat watesan, sehingga nama watesan diangkat menjadi waes dan tiga dukuhan tadi digabung menjadi satu desa yaitu desa Wates. Pada tahun 1984 masa pemerintahan kepada desa yang dijabat oleh kartekr kepolisian yaitu bapak Kemat Koesmadi, desa Wates dijadikan dua dusun yaitu dusun  Nglegok dan dusun Duwet.

                Daftar nama tokoh masyarakat yang pernah memimpin desa Wates, diantaranya:

1.       Lurah H Ismail

2.       Lurah Jatirto

3.       Lurah H Syakur

4.       Lurah Ari

5.       Lurah Kemat Koesmadi

6.       Lurah Samroni

7.       Lurah Djani 

        Lurah Rudhianto

Ini merupakan kilas sejarah asal-usul terbentuknya desa Wates. Setidaknya sejarh tersebut terus dikenang dan dipahami sebagai wujud rasa hormat pada leluhur yang membangun desa Wates.